Достатня кількість опадів і помірні температури повітря обумовлюють розвиток збудників таких хвороб соняшнику як несправжня борошниста роса, біла гниль, фомоз, фомопсис. Водночас існують патогени, розвитку яких сприяють висока температура й посушливі умови. Зокрема, збудник вугільної гнилі краще почувається в умовах низької вологості ґрунту й за температури повітря 28-30°С. Збудник фомозу під час посухи зменшує врожай насіння соняшнику через передчасне його дозрівання. В посушливих умовах подовжується тривалість зберігання у ґрунті збудника білої гнилі (у вигляді склероціїв), насіння вовчку. Оптимальними умовами розвитку збудника вертицильозного в’янення соняшнику є тривала посуха та спекотна погода. Для контролю хвороб соняшника проводять профілактичні або лікувальні обробки фунгіцидами: Імпакт К, КС 0,8-1 л/га, Танос, в.г. 0,4-0,6 к л/га, Дерозал, КС 0,5 л/га, Пропульс, СЕ 0,8-1,0 л/га, Аканто Плюс, КС 0,5-1,0 л/га, або іншими.
Хімічні засоби регулювання чисельності шкідників соняшнику застосовують тоді, коли їх кількість перевищує пороги шкідливості. Для захисту від гусені люцернової совки або інших лускокрилих комах, клопів, бурякової та геліхризової попелиць використовують Фуфанон 570, КЕ 0,6-0,8 л/га, Децис f-Люкс, КЕ 0,3-0,5 л/га, Моспілан, ВП 0,05-0,075 л/га, Енжіо 247 SC, к.с. 0,18 л/га, або інші.